Sains club yaitu penambaha mata pelajaran sainsyang kami kemas dengan sangat menyenangkan jadi di SD Muhammadiyah Kutoarjo juga memperhatikan anak-anak yang gemar dalam matapelajaran sains, sehingga anak-anak dapat lebih dalam mengetahu tentang sains. Pada sains club ini anak-anak juga di proyeksikan untuk mengikuti formal seperti OSN. Banyak juga prestasi yang sudah di raih oleh anak-anak fun sains